由于种肥常和种子接触或与种子距离较近，因此种植时对肥料使用方法和用量有较严的要求。一旦施用不当，将会引起烧苗烂种和缺苗断垅现象。因此，凡浓度过高、过酸、过碱或含有毒性物质的化肥及产生高温的化肥均不宜做种肥施用。一般以速效性化肥或腐熟良好的优质农肥做种肥。生产上可做种肥的化肥有如下几种： 
 
　　硫酸铵简称硫铵。做种肥时随种下肥时应避免与种子的过多接触。拌种，是一种经济有效的施种肥方法(每亩用肥量2.5公斤)，但要保证种子与硫铵呈干燥状态，并确保随伴随播不可久置。 
 
　　过磷酸钙 简称普钙。施用时先把普钙碾细过筛，最好拌上优质农肥，避免普钙与幼苗接触发生烧苗现象。亩施肥量以5至10公斤为宜。 
 
　　重过磷酸钙简称重钙。用作种肥时亩施肥量2.5至5公斤为宜。由于重钙不含硫酸钙，故对喜硫作物(如马铃薯、豆类作物)的施肥效果不及普钙。此外，施在碱牲土壤中的效果也不及普钙。